Epidemiologická situace se v současnosti výrazně zhoršuje v počtech nových případů, ale počty hospitalizovaných zatím mají klesající trend. Varianta omikron se přenáší s vyšší účinností a nyní její podíl přesahuje v České republice 95 procent všech provedených testů metodou diskriminační PCR. Podezření na variantu BA.2, která v Evropě dominuje v Dánsku a Švédsku, aktuálně testy diskriminační PCR na území ČR ukazují ve 173 možných záchytech. Tyto nálezy je třeba ověřit sekvenací. Klinická praxe v zasažených zemích ale dosud nehlásí změny v průběhu onemocnění ani v počtech hospitalizací v souvislosti s touto variantou.
V období od 16. 1. do 23. 1. 2022 (dle data odběru) má Národní referenční laboratoř (NRL) k dispozici data z 83 685 provedených testů diskriminační PCR z 90 laboratoří. Omikron podle těchto testů už prakticky vytlačil deltu a její subvarianty.
K 24. 1. 2022 bylo v ČR celogenomově sekvenováno 24 631 SARS-CoV-2 pozitivních vzorků. Celkem 1 514 sekvenací je s datem odběru vzorku mezi 24. prosincem a 24. lednem. I v těchto podrobných testech, jejichž výsledky se ale promítají do databáze se zpožděním zhruba 14 dnů, převažovala varianta omikron BA.1 ze zhruba 60 procent. Zbylá procenta ještě patří, se zmíněným zpožděním, deltě a jejím subvariantám.
V ČR bylo za posledních 14 dní (tj. od 10. 01. do 23. 01. 2022) zachyceno 232 157 případů SARS-CoV-2 pozitivních osob, s denním průměrem přibližně 16 583 případů, což představuje 14denní incidenci 2 169 na 100 000 obyvatel. Za uvedené období je nahlášeno 2 177 hospitalizací. Celkový počet hospitalizací ke konci sledovaného období činí 1 448 osob, z toho 257 s vážným průběhem.
Často v posledních dnech médii dotazovaná varianta BA.2 byla popsána 6. 12. 2021 a původně kategorizována jako subvarianta omikronu (B.1.1.529) a jako příbuzná sublinii BA.1., která je v ČR dominantní. Podle posledních poznatků se však zřejmě jedná o s omikronem nepříbuznou subvariantu. V České republice ji celogenomová sekvenace dosud prokázala pouze v jednom případě, a to v prosinci na Ostravsku. Nově zachytily diskriminační PCR testy suspektní BA.2 ve 173 případech, což představuje ve zmíněných datových sadách necelá 4 procenta případů.
„Ačkoli varianta BA.2 přitahuje pozornost odborné i laické veřejnosti, klinická praxe zatím v zasažených zemích nehlásí změny v průběhu onemocnění, nebo v počtech hospitalizovaných v přímé souvislosti právě s touto variantou. Na podrobnější závěry je zatím příliš brzy, je třeba vyhodnotit více dat,“ shrnula dosavadní poznatky dostupné ze zahraniční praxe ředitelka SZÚ Barbora Macková.